壹、融合多種醫學理論

    蒙醫藥學是一個獨立的完整的，不同于中醫、西醫理論的醫學體系。它吸收了藏傳佛教醫學、中醫理論、古印度醫學理論、古波斯醫學理論精華，遵循“天人合一”“三因學說”為理論基礎。赫依、協日、巴達干，三因素相互依賴，相互制約。

    貳、懂醫的人能做藥   做藥的人能看病

    獨特而神秘的蒙古醫學。在蒙醫中，懂醫的人能做藥，做藥的人能看病。蒙醫藥與藏傳佛教、薩滿教淵源深厚，佛教密宗把行醫施藥理解為一種普度眾生的慈悲，這種普度眾生慈悲為懷的精神，至今仍是蒙醫藥行業的最高標準。

    叁、采取生味入藥，藥性強、藥勁大，副作用小。

    蒙古草原特殊的地理環境：如礦物質土壤、天然原生藥草資源、無污染、晝夜溫差大、光合作用強等因素，造就了蒙藥有效成份累積高，活性強；采取生味入藥，藥性強、藥勁大，副作用小。這些都是其它地區藥材無法代替和比擬的。

    肆、經典傳世方 

    蒙藥是蒙古族人民在草原惡劣的環境中與疾病斗爭的經驗總結，尤其是心腦血管疾病和風濕骨病，蒙醫古方、蒙醫驗方療效突出；蒙古族人民喝酒吃肉，高血脂、高血壓、高血糖、腦血栓、腦卒中、冠心病、半身不遂等疾病較多，因此，在全國各民族保存下來療效顯著的古方中，蒙醫藥在心腦疾病類的蒙藥是強項。又如：騎馬損傷的骨病，草原風沙大，寒冷氣候導致的風濕骨病等，更是蒙醫藥的拿手絕活；經過上千年的優勝劣汰，流傳到現在的，都是療效最好的方劑。傳世的藥才是療效最好的藥。

    伍、草原上天然野生藥材

    蒙藥所用的藥材大多都是草原上天然野生藥材，即采即用。古代草原蒙醫藥被總結為“麂皮做袋，坐地診脈；馬背馱藥、蒙古瑰寶”。

    陸、蒙藥會用到很多草原上的名貴藥材，這也是藥效好的有力保證。